Rosetta
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Rosetta＠homeは、世界中のインターネットに接続したコンピュータを使うBOINCによる科学研究プロジェクトです。
蛋白質立体構造ならびに蛋白質-蛋白質間と蛋白質-リガンド相互作用を予測し設計することを目的とします。
私たちの最終的なゴールは、正確に蛋白質立体構造とその複合体を予測し設計する手法を確立し、
HIV/エイズ、ガン、マラリア、アルツハイマーなどのような人間の難病に対する治療法に一役買うことであります。
■将来の計画
私たちの手法は、CASPとCAPRI実験でテストされており、私たちの公的に利用可能な蛋白質構造予測サーバ（Robetta）で実装されます。
そして、それが無料で世界中から何百人もの権威ある数々の科学者によって現在使用されており、
最近のCASP実験では自動構造予測サーバのうち最高の1台であることが証明されました。
数多くのRosetta＠home参加ボランティアが今後も増えるならば、私たちもRobettaサーバによる構造予測の長い待ち期間を減らし、
そして現在まだ提供することができていない数多くの研究にその門戸をさらに増やしていくことを可能にする計算資源を提供するため、
今後もこのRosetta＠homeを運用してゆく予定であります。
Rosetta＠homeに参加するにはこれらの条件を満たしているPCである必要があります。
メモリが足りていない(256MB以下)とエラーになるので注意。
BOINCクライアントをまだ入手してないならここから落としてインストールします。
BOINCクライアントの「Add Project」*1からプロジェクト追加画面へ。初回起動なら自動的に追加画面が開きます。
URLは「http://boinc.bakerlab.org/rosetta/」。メアドとパスを要求されるので入れる。パスはメモしておく。
入力が終わるとブラウザが開き名前と国・郵便番号を入れるページに行くので入力する。名前は「名前@板名」で。
デフォでユーザー名になってるので変える。
名前を入れるとアカウント情報のページに行く。その状態でこのTeam 2chのページへ行きJoin This Teamの所のJoinを押す。
言語設定のページで「Japanese」を選択すると表示を日本語に出来ます。*2
各種設定はここ。
CPU使用率はクライアント側で指定するかここのEdit preferencesで設定す。
デフォでDo work while computer is in use?がnoになってる(PC使用時に解析しない)のでここのEdit preferencesでYesにする。noのままだとアイドル時にしか解析しない。
Managerのアクティビティで常時稼動にしてあるなら関係ない。
成績や宿題の提出状況等はYour accountのWork doneの項で確認できます。Your accountの説明。
Team 2ch内のランキングは公式で。
設定していないと3時間のものになる。設定しなくても問題ない。
NOTE:設定時間に応じた固さのWUが送られてくるようになる。対象たんぱく質の見かけが大きいものの方が解析に時間がかかる。1WUには最低1たんぱく質の情報が入っており、この個数・固さ（＝たんぱく質の大きさ）が調整されてPCに届くようになっている。それは解析に時間のかかる大きなたんぱく質が１つWUに入っている場合もあるし、小さなたんぱく質が数個WUに入っている可能性もあるということである。現在何個目を処理中であるかは、グラフィック表示の"Model"の数で確認することができる。
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